Factors influencing the accuracy of genomic prediction in plant breeding

Schopp, Pascal

Factors influencing the accuracy of genomic prediction in plant breeding

dc.contributor.advisor	Melchinger, Albrecht E.	de
dc.contributor.author	Schopp, Pascal	de
dc.date.accepted	2018-03-11
dc.date.accessioned	2024-04-08T08:56:40Z
dc.date.available	2024-04-08T08:56:40Z
dc.date.created	2019-01-28
dc.date.issued	2017
dc.description.abstract	Genomic prediction (GP) is a novel statistical tool to estimate breeding values of selection candidates without the necessity to evaluate them phenotypically. The method calibrates a prediction model based on data of phenotyped individuals that were also genotyped with genome-wide molecular markers. The renunciation of an explicit identification of causal polymorphisms in the DNA sequence allows GP to explain significantly larger amounts of the genetic variance of complex traits than previous mapping-based approaches employed for marker-assisted selection. For these reasons, GP rapidly revolutionized dairy cattle breeding, where the method was originally developed and first implemented. By comparison, plant breeding is characterized by often intensively structured populations and more restricted resources routinely available for model calibration. This thesis addresses important issues related to these peculiarities to further promote an efficient integration of GP into plant breeding.	en
dc.description.abstract	Die genomische Leistungsvorhersage (GLV) ist ein neues statistisches Werkzeug zur Zuchtwertschätzung von Selektionskandidaten ohne die Notwendigkeit diese zuvor zu phänotypisieren. Die Methode kalibriert ein Vorhersagemodell auf Basis bereits phänotypisierter Individuen, welche zudem mit genomweiten molekularen Markern genotypisiert wurden. Der Verzicht auf die explizite Identifikation von kausalen Polymorphismen in der DNA-Sequenz ermöglicht der GLV signifikant größere Anteile der genetischen Varianz komplexer Merkmale zu erklären als frühere, kartierungsbasierte Ansätze zur markergestützten Selektion. Aus diesen Gründen revolutionierte die GLV bereits die Milchrinderzüchtung, in welcher die Methode ursprünglich entwickelt und auch erstmalig praktisch angewendet wurde. Im Vergleich hierzu zeichnet sich die Pflanzenzüchtung durch starke Populationsstruktur und stärker limitierte Ressourcen für den Zweck der Modellkalibration aus, welche in regelmäßigen Abständen zur Verfügung stehen. Die vorliegende Arbeit widmet sich wichtigen Fragen, die sich aus diesen Eigenschaften ergeben, um eine effizientere Integration der GLV in der Pflanzenzüchtung zu fördern.	de
dc.identifier.swb	516629719
dc.identifier.uri	https://hohpublica.uni-hohenheim.de/handle/123456789/6336
dc.identifier.urn	urn:nbn:de:bsz:100-opus-15598
dc.language.iso	eng
dc.rights.license	publ-mit-pod	en
dc.rights.license	publ-mit-pod	de
dc.rights.uri	http://opus.uni-hohenheim.de/doku/lic_mit_pod.php
dc.subject	Plant breeding	en
dc.subject	Maize	en
dc.subject	Corn	en
dc.subject	Genomic prediction	en
dc.subject	Genomic selection	en
dc.subject	Genomische Leistungsvorhersage	de
dc.subject	Quantitative Genetik	de
dc.subject.ddc	630
dc.subject.gnd	Pflanzenzüchtung	de
dc.subject.gnd	Genetik	de
dc.subject.gnd	Mais	de
dc.subject.gnd	Biostatistik	de
dc.subject.gnd	Marker	de
dc.title	Factors influencing the accuracy of genomic prediction in plant breeding	de
dc.title.dissertation	Faktoren, die die Genauigkeit der genomischen Leistungsvorhersage in der Pflanzenzüchtung beeinflussen	de
dc.type.dcmi	Text	de
dc.type.dini	DoctoralThesis	de
local.access	uneingeschränkter Zugriff	en
local.access	uneingeschränkter Zugriff	de
local.bibliographicCitation.publisherPlace	Universität Hohenheim	de
local.export.bibtex	@phdthesis{Schopp2017, url = {https://hohpublica.uni-hohenheim.de/handle/123456789/6336}, author = {Schopp, Pascal}, title = {Factors influencing the accuracy of genomic prediction in plant breeding}, year = {2017}, school = {Universität Hohenheim}, }
local.export.bibtexAuthor	Schopp, Pascal
local.export.bibtexKey	Schopp2017
local.export.bibtexType	@phdthesis
local.faculty.number	2	de
local.institute.number	350	de
local.opus.number	1559
local.university	Universität Hohenheim	de
local.university.faculty	Faculty of Agricultural Sciences	en
local.university.faculty	Fakultät Agrarwissenschaften	de
local.university.institute	Institute for Plant Breeding, Seed Science and Population Genetics	en
local.university.institute	Institut für Pflanzenzüchtung, Saatgutforschung und Populationsgenetik	de
thesis.degree.level	thesis.doctoral

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Institut für Pflanzenzüchtung, Saatgutforschung und Populationsgenetik