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Doctoral Thesis
2008
Molekulare und entwicklungsbiologische Charakterisierung von Schlüsselenzymen der Naturstoffbiosynthese in Drüsenhaaren der Sonnenblume
Molekulare und entwicklungsbiologische Charakterisierung von Schlüsselenzymen der Naturstoffbiosynthese in Drüsenhaaren der Sonnenblume
Abstract (English)
Glandular trichomes from anther appendages of sunflower were collected and their RNA was isolated. Sequence comparison with known plant sesquiterpene synthases was used to identify sunflower synthases in RT-PCR reactions. Three enzymes, HaGAS1, HaGAS2 and HaCS with high similarities to already characterized sesquiterpene synthases were identified. Their nucleotide sequences were completely established on the genomic level and as RNA transcripts. The nucleotide sequences as well as the deduced amino acid sequences showed typical characteristics of terpene synthases.
In order to characterize the enzymes, the sesquiterpene synthase genes were cloned and expressed in E. coli. In vitro assays with the recombinant enzymes were carried out using the native substrate farnesyldiphosphate. The resulting products were extracted and analysed by GC-MS. They were identified by comparison of data base MS-data and using reference samples under identical analytical conditions. Two expressed enzymes, HaGAS1 and HaGAS2, synthesized germacrene A as a single product. Heterologous in vivo expression of both germacrene A-synthases in S. cerevisiae confirmed the in vitro result, since the analysis of the synthesized product showed a single germacrene A peak.
Due to a very low in vitro activity of HaCS, the products of the third synthase could not be directly determined by MS-analysis. Therefore, the enzyme was expressed as a thioredoxin-fusion protein in vivo in transgenic yeast. This attempt resulted in a much higher rate of product yield. Two main and at least six minor products were traced in GC-analysis. They were confirmed as sesquiterpene hydrocarbons by GC-MS analysis. One of the two main products was identified as gamma-cadinene, whereas the second main peak could not be determined conclusively. Among the minor compounds alpha-copaene, alpha-muurolene und beta-caryophyllene were identified.
Screening of a H. annuus EST library (established at the Berkeley Center for Synthetic Biology, University of California, Berkeley, USA) from mRNA of trichomes revealed the presence of a cytochrome P450 protein which showed high similarity to an Artemisia annua enzyme involved in artemisinic acid biosynthesis. This enzyme and another similar protein from Lactuca sativa were cloned and coexpressed with the germacrene A-synthase HaGAS2 in yeast. The resulting product was indirectly determined as germacrene A carboxylic acid using GC-MS analysis. These novel cytochrome P450 enzymes from sunflower and lettuce can be characterized as multifunctional germacrene A-monooxygenases. They catalyse a three-step oxidation leading from germacrene A to germacrene A carboxylic acid. This oxidation process represents an essential step towards the biosynthesis of sesquiterpene lactones.
Semiquantitative RT-PCR analysis demonstrated that the expression of all three sesquiterpene synthases and the sunflower P450 monooxygenase occurred directly within trichome cells. The expression was highly upregulated during the secretory stage of the capitate glandular trichomes. This developmentally regulated expression was shown for the first time in trichomes. Additionally to sesquiterpene synthase activity in trichomes of anthers and leaves, it also was detected in sunflower roots.
In addition, 5-deoxynevadensin was identified as a new constituent of the glandular trichomes of sunflower. This 5-deoxy-flavone is responsible for the bright blue fluorescence of sunflower trichomes detected by fluorescence microscopy. The newly identified component may act as protectant for the STL against UV-degradation.
Abstract (German)
In der vorliegenden Arbeit konnten durch Sequenzvergleiche mit bereits bekannten pflanzlichen Sesquiterpensynthasen drei in den Trichomen der Sonnenblume exprimierte Sesquiterpensynthasen identifiziert werden. Die Nuklein- und Aminosäuresequenzen wiesen für Terpensynthasen charakteristische Merkmale auf. Zur funktionellen Charakterisierung wurden alle identifizieren Terpensynthasen heterolog in E. coli exprimiert. Nach Aufreinigung und in vitro Umsetzungsreaktionen mit dem natürlichen Substrat Farnesylpyrophosphat wurden die Reaktionsprodukte durch GC-MS Messungen analysiert und die gebildeten Verbindungen anschließend anhand von Referenzproben bestimmt. Zwei der identifizierten Sesquiterpensynthasen (HaGAS1, HaGAS2) erwiesen sich als Germacren A-Synthasen und somit als die Schlüsselenzyme der Biosynthese der Sesquiterpenlactone der Sonnenblume. Die heterologe Expression der Germacren A-Synthasen in vivo in S. cerevisiae führte ebenfalls nur zur Bildung von Germacren A und war damit übereinstimmend mit den in vitro Daten.
Die funktionelle Charakterisierung der dritten Terpensynthase erwies ich aufgrund schwacher in vitro Aktivität als schwierig. Eine heterologe Expression in vivo in S. cerevisiae führte zu einer deutlichen Steigerung der erhaltenen Produktmengen. Doch erst die Expression als Thioredoxin-Fusionsprotein in Hefen ermöglichte die Bildung genügend hoher Produktmengen zur Identifizierung der gebildeten Verbindungen. Bei dieser Sesquiterpen-synthase (HaCS) handelt es sich um ein Multiproduktenzym, welches als eine von zwei Hauptkomponenten gamma-Cadinen bildet und als weitere Produkte alpha-Copaen, alpha-Muurolen und beta-Caryophyllen produziert.
In einer H. annuus Trichom EST-Bank wurde ein Cytochrom P450-Enzym identifiziert, das eine hohe Sequenzähnlichkeit zu einem bereits charakterisierten Gen aus Artemisia annua aufwies, welches an der Bildung von Artemisinin-Säure beteiligt ist. Die heterologe Expression dieses Enzyms und eines weiteren Proteins mit hoher Sequenzähnlichkeit aus Lactuca sativa zusammen mit der Germacren A-Synthase HaGAS2 in S. cerevisiae führte zur Bildung von Germacren A-Carboxylsäure und damit zur Aufklärung eines bisher nicht auf enzymatischer Ebene identifizierten Biosyntheseschrittes der Sesquiterpenlactone. Bei den identifizierten Enzymen aus H. annuus beziehungsweise L. sativa handelt es sich um multifunktionelle Germacren A-Monooxygenasen, die drei aufeinanderfolgende oxidative Schritte der Bildung von Germacren A-Carboxylsäure aus Germacren A katalysieren.
Semiquantitative RT-PCR Experimente konnten die Expression aller drei identifizierten Sesquiterpensynthasen, sowie der Monooxygenase der Sonnenblume, direkt in den Trichomen zeigen. Die Expression der Gene fand nur während der biosynthetisch aktiven Phase der Trichome statt und konnte in dieser Feinheit zum ersten Mal überhaupt gezeigt werden. Daneben wurden Transkripte der Sesquiterpensynthasen in trichomtragenden Blättern und im Wurzelbereich nachgewiesen. Neben Sesquiterpenlactonen wurden von den Drüsenhaaren auch Flavonoide gebildet, deren Biosynthese ebenfalls in den Trichomen angesiedelt ist. Mit 5-Deoxynevadensin konnte ein bisher unbekanntes und trichomspezifisches 5-deoxy-Flavon identifiziert werden.
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Faculty of Natural Sciences
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Institute of Botany
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2008-06-03
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German
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Publisher place
Classification (DDC)
580 Plants
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Standardized keywords (GND)
Sustainable Development Goals
BibTeX
@phdthesis{Göpfert2008,
url = {https://hohpublica.uni-hohenheim.de/handle/123456789/5195},
author = {Göpfert, Jens C.},
title = {Molekulare und entwicklungsbiologische Charakterisierung von Schlüsselenzymen der Naturstoffbiosynthese in Drüsenhaaren der Sonnenblume},
year = {2008},
school = {Universität Hohenheim},
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